W Muzeum czynna jest wystawa poświęconą pamięci Marcina Antonowicza, przygotowana przez Instytut Pamięci Narodowej. Na wystawie zgromadzono zdjęcia Marcina Antonowicza, dokumenty związane ze śledztwami po jego śmierci oraz materiały prowadzonej przez olsztyńską SB sprawy operacyjnej o kryptonimie „Student”, która dokumentowała nieprzychylne wobec władzy nastroje społeczne. Pochodzący z Olsztyna 19-letni student Uniwersytetu Gdańskiego w powszechnej opinii olsztynian jest uważany za ofiarę komunizmu. Jego pogrzeb w 1985 r. zgromadził kilkanaście tysięcy ludzi i stał się największą w Olsztynie demonstracją opozycyjną.